baserCMS３は、CakePHP２系に対応する為、アーキテクチャが大幅に変更となっている為、残念ながら、現時点（2013年12月2日）では、旧バージョンからのアップデートはサポートしておりません。

近いうち、旧バージョンのデータ変換ツールがプラグインとしてリリースされる可能性がありますのでそれまでお待ちください。

※ どうしても、すぐにバージョンアップを希望されている場合は、（株）キャッチアップが提供しているビーコミのバージョンアップサービスを利用するのも一つの手かもしれません。サービス提供元に問い合わせてみてください。